הכנסייה הפרוטסטנטית של Saint-Thomas היא דוגמה מצוינת לאמנות גותית אלזס. מקורותיו של בניין הכנסייה חוזרים למנזר בנדיקטיני משנת 600. המנזר הוקדש לשליח תומאס. הבישוף אדלוג הורה לבנות כאן כנסייה ובית ספר חדשים במאה ה-9. עם זאת, בשנת 1007 פגיעת ברק בבניין ושריפה הפחיתה אותו להריסות. בנייתה בפועל של הכנסייה כפי שאנו מכירים אותה היום החלה אפוא במאה ה-12. הודות לזכות פינוק, ניתן היה להתחיל בבניית החזית בשנת 1196. החלק העתיק ביותר של הכנסייה הוא קפלת בלסיוס מצפון למקהלה. הספינה הושלמה בסוף המאה ה-13. בשנת 1330 נוספו שתי ספינות נוספות. העיר שטרסבורג ארגנה בניית בית ספר ב-1536.כנסיית סנט תומס היא כנסיית אולם בת חמש ספינות. האורך בפנים 65 מטר, הרוחב 30 מטר והגובה הפנימי 22 מטר. מבחינת סגנון, המבנה מייצג תערובת של אלמנטים רומנסקיים וגותיים. אלמנטי הבנייה המוקדמים ביותר עדיין שייכים למסורת הרומנסקית, כמו מגדל השער המסיבי. הטרנספט עם מגדל המעבר, שנבנה במאה ה-13, והמקהלה נושאים צורות גותיות. הקפלות הצדדיות, שנבנו רק במאה ה-16, הן בסגנון גותי מאוחר. מבין חלונות זכוכית העופרת המקוריים מימי הביניים, רק חלון הוורד עדיין בחזית. החלונות הנותרים מעוטרים בעיקר במוטיבים צמחיים, לאחר שרבים מתיאורי הקדושים נפלו קורבן לאיקונוקלסטים לותרניים.כנסיית סנט תומאס מתגיירת לאמונה הלותרניתבשנת 1524, כנסיית סנט תומס פנתה לאמונה הלותרנית. גם כאשר אלזס סופחה לצרפת הקתולית, הכנסייה שמרה על האתוס הלותרני שלה. כך היה גם לגבי הקרן הקולגיאטית ורכושה. מאוחר יותר, תומאסקירשה היה המקום שבו פרידריך ספיטה חזר על צורות פולחן חדשות במהלך "התנועה הליטורגית הישנה יותר".אנדריאס זילברמן השיג עוגב מרשים בכנסיית תומסקירשה במאה ה-17. וולפגנג אמדאוס מוצרט ניגן בו ב-1778, ואחר כך אלברט שוויצר לזכרו של יוהאן סבסטיאן באך. בשנת 1979 שוחזר עוגב זילברמן על ידי אלפרד קרן. בנוסף לעוגב זילברמן, לתומסקירשה יש גם עוגב שני וקטן יותר. בשנת 1905 בנה פריץ הארפפר את עוגב המקהלה הקטן יותר לפי תוכניותיו של אלברט שוויצר.כנסיית סנט תומס מפורסמת באנדרטאות הקבורה שלה. האנדרטאות מתוארכות בין השנים 1130 ל-1850, כולל הקבר הרומנסקי של הבישוף אדלוג מהמאה ה-12. כדאי לראות גם את קברו של המפקד הצרפתי מרשל מוריץ מסקסוניה, שמת בשנת 1750. האנדרטה הושלמה בשנת 1776 על ידי ז'אן-בטיסט פיגאל. הקבר המרשים ממוקם באפסיס ומראה את המרשל צועד במורד גרם מדרגות לתוך הארון, בעוד צרפת המתוארת בצורה פיגורטיבית מנסה לעכב אותו.
