Протестантская церковь Сен-Томас является прекрасным примером эльзасской готики. Истоки здания церкви восходят к бенедиктинскому монастырю 600 года. Монастырь был посвящен апостолу Фоме. В 9 веке епископ Адалог приказал построить здесь новую церковь и школу. Однако в 1007 году в здание ударила молния, и пожар превратил его в руины. Таким образом, строительство церкви в том виде, в котором мы знаем ее сегодня, началось в 12 веке. Благодаря привилегии на индульгенцию, строительство фасада было начато в 1196 году. Самой старой частью церкви является часовня Блазиуса, расположенная к северу от хора. Строительство нефа было завершено в конце 13 века. В 1330 году были добавлены еще два нефа. В 1536 году город Страсбург организовал строительство школы.
Церковь Святого Фомы - это пятинефная зальная церковь. Длина внутри составляет 65 метров, ширина - 30 метров, а внутренняя высота - 22 метра. С точки зрения стиля здание представляет собой смесь романских и готических элементов. Самые ранние элементы здания все еще относятся к романской традиции, например, массивная надвратная башня. Трансепт с перекрестной башней, построенной в 13 веке, и хор имеют готические формы. Боковые капеллы, которые были построены только в 16 веке, выполнены в стиле поздней готики. Из оригинальных средневековых окон со свинцовым стеклом на фасаде сохранилось только окно с розой. Остальные окна в основном украшены растительными мотивами, так как многие изображения святых стали жертвой лютеранских иконоборцев. Церковь Святого Фомы переходит в лютеранскую веру В 1524 году церковь Святого Фомы перешла в лютеранскую веру. Даже когда Эльзас был присоединен к католической Франции, церковь сохранила свой лютеранский дух. То же самое касалось и коллегиального фонда и его владений. Позже Томаскирхе стала местом, где Фридрих Шпитта репетировал новые формы богослужения в ходе "старшего литургического движения".
В 17 веке Андреас Зильберманн создал в Томаскирхе внушительный орган. В 1778 году на нем играл Вольфганг Амадей Моцарт, а позже Альберт Швейцер в память об Иоганне Себастьяне Бахе. В 1979 году орган Зильберманна был отреставрирован Альфредом Керном. Помимо органа Зильберманна, в Томаскирхе есть второй, меньший орган. В 1905 году Фриц Хаерпфер построил малый хоровой орган по планам Альберта Швейцера.
Церковь Святого Фомы знаменита своими погребальными памятниками. Памятники датируются периодом между 1130 и 1850 годами, включая романскую гробницу епископа Аделога 12-го века. Также стоит увидеть гробницу французского полководца маршала Морица Саксонского, умершего в 1750 году. Памятник был завершен в 1776 году Жаном-Батистом Пигалем. Внушительная гробница расположена в апсиде и изображает маршала, спускающегося по лестнице в гроб, в то время как образно изображенная Франция пытается его задержать.
