Mótmælendakirkjan í Saint-Thomas er frábært dæmi um gotneska list í Alsace. Uppruni kirkjubyggingarinnar er frá Benediktínuklaustur frá árinu 600. Klaustrið var tileinkað Tómasi postula. Adalog biskup lét byggja nýja kirkju og skóla hér á 9. öld. Hins vegar árið 1007 sló elding niður í bygginguna og eldur gerði hana í rúst. Raunveruleg bygging kirkjunnar eins og við þekkjum hana í dag hófst því á 12. öld. Þökk sé eftirlátsréttindum var hægt að hefja byggingu framhliðarinnar árið 1196. Elsti hluti kirkjunnar er Blasíuskapellan norðan við kórinn. Skipið var fullgert í lok 13. aldar. Árið 1330 var tveimur skipum til viðbótar bætt við. Borgin Strassborg skipulagði byggingu skóla árið 1536.Tómasarkirkja er fimmskipa salkirkja. Lengd að innan er 65 metrar, breidd 30 metrar og innri hæð 22 metrar. Hvað varðar stíl, táknar byggingin blöndu af rómönskum og gotneskum þáttum. Elstu byggingarþættirnir tilheyra enn rómönsku hefðinni, svo sem risastóri hliðturninn. Þverskipið með þverturninum, sem var byggður á 13. öld, og kórinn bera gotneskar form. Hliðarkapellurnar, sem ekki voru byggðar fyrr en á 16. öld, eru í síðgotneskum stíl. Af upprunalegum blýglergluggum frá miðöldum er aðeins rósaglugginn enn í framhliðinni. Hinir gluggarnir sem eftir eru eru aðallega skreyttir með plöntumyndum, eftir að margar myndir af dýrlingum urðu fórnarlamb lútherskra helgimynda.Tómasarkirkjan breytist til lúterskrar trúarÁrið 1524 sneri heilagi Tómasarkirkjan sér að lúterskri trú. Jafnvel þegar Alsace var innlimuð af kaþólska Frakklandi, hélt kirkjan sínu lúterska siðferði. Sama gilti um háskólastofnunina og eigur hennar. Síðar var Thomaskirche staðurinn þar sem Friedrich Spitta æfði nýjar tegundir tilbeiðslu í tengslum við "eldri helgisiðahreyfingu".Andreas Silbermann náði glæsilegu orgeli í Thomaskirche á 17. öld. Wolfgang Amadeus Mozart lék á það árið 1778 og síðar Albert Schweitzer til minningar um Johann Sebastian Bach. Árið 1979 var Silbermann-orgelið endurreist af Alfred Kern. Auk Silbermann-orgelsins er í Thomaskirche einnig annað, minna orgel. Árið 1905 smíðaði Fritz Haerpfer minna kórorgelið samkvæmt áætlunum Alberts Schweitzer.Tómasarkirkjan er fræg fyrir útfararminjar. Minjarnar eru frá 1130 til 1850, þar á meðal rómönsk grafhýsi Adelog biskups frá 12. öld. Einnig er vert að skoða gröf franska herforingjans Moritz Marshals af Saxlandi, sem lést árið 1750. Minnisvarðinn var fullgerður árið 1776 af Jean-Baptiste Pigalle. Hin glæsilega grafhýsi er staðsett í apsi og sýnir marskálkann stíga niður stigann í kistuna, á meðan Frakkland sem sýnd er í óeiginlegri mynd reynir að halda honum frá sér.
