St Thomas Church je nejznámější jako místo, kde Johann Sebastian Bach působil jako Kapelník (hudební režisér), od roku 1723 až do své smrti v roce 1750, a jako místo jeho ostatky.Od roku 1950 jsou v Thomaskirche pohřbeny kosti Johanna Sebastiana Bacha. Dalším pozoruhodným rysem Thomaskirche je, že obsahuje dva orgány. Starší je romantický varhany Wilhelma Sauera, postavený v letech 1885-89. Protože tento orgán je považován za "nevhodné" pro Bach\'s, hudby, druhý orgán byl postaven Gerald Woehl\'s varhany stavební firma z 1999-2000. Tento " Bach varhany " byl navržen tak, aby vypadal podobně jako staré varhany, na kterých Bach hrál v Paulinerkirche.Ve zvonici Svatého Tomáše jsou čtyři zvony. Největší je Gloriosa, kterou v roce 1477 obsadil Theodericus Reinhard.
