Sant Tomàs de l'Església és el més famós com el lloc on Johann Sebastian Bach va treballar com a Kapellmeister (director musical) de 1723 fins a la seva mort a l'any 1750, i com la ubicació de les seves restes.Des de 1950, els ossos de Johann Sebastian Bach són enterrats a la Thomaskirche. Una altra característica notable de la Thomaskirche és que conté dos òrgans. La més antiga és un Romàntic òrgan per Guillem Sauer, construït a partir de 1885-89. Des d'aquest òrgan es considera "inadequat" per Bach\'s de música, un segon orgue va ser construït per Gerald Woehl\'s òrgan edifici de la companyia des de 1999-2000. Aquest "Bach per a orgue" va ser dissenyat per un aspecte similar a l'antic orgue que Bach havia jugat en el Paulinerkirche.Hi ha quatre campanes en la St. Thomas campanar. La més gran és la Gloriosa, que va ser llançat per Theodericus Reinhard en 1477.
