כאשר נבדקו לראשונה בשנות ה-60 על ידי אנתרופולוגים מאוניברסיטת שיקגו ואוניברסיטת איסטנבול, הוא נדחה כשרידים של בית קברות נטוש מימי הביניים. כיום, גבקליטפה נחשב למקדש העתיק ביותר בעולם עוד לפני כ-9000 לפני הספירה. בשנת 1994, קלאוס שמידט מהמכון הארכאולוגי הגרמני ביקר בהריסות והרגיש שהם היו מבוגרים יותר ומעניינים יותר ממה שחשבו החוקרים הקודמים.
שנה לאחר מכן, שמידט וצוות קטן חשפו את המגליתים הראשונים והמשיך לחפור באתר עד מותו בשנת 2014. עד הגילוי של שמידט, ארכיאולוגים האמינו כי חקלאות להוביל להיווצרות של התרבויות הראשונות, אבל שמידט ומחקרים אחרים עכשיו מאמינים שזה היה יכול להיות להיפך.
