Winnipeg Gölü (Manitoba Gölü ile birlikte), son buzul çağından kalma tarih öncesi Agassiz Gölü'nün kalıntılarıdır. O göl o kadar büyüktü ki dünyanın iklimini değiştirdi ve beş Büyük Gölün toplamından daha büyüktü. Yaklaşık 4000 yıl önce ortadan kayboldu.
Winnipeg Gölü büyüktür, ancak aynı zamanda nispeten sığdır. Kanada'nın altıncı en büyük tatlı su gölü ve tamamen Kanada'da bulunan üçüncü en büyük göldür. Çoğu gelişmemiş olan birçok adaya ev sahipliği yapmaktadır.