O lago Winnipeg (xunto co lago Manitoba) son restos do prehistórico lago Agassiz da última idade de xeo. Ese lago era tan grande que cambiou o clima do mundo e era máis grande que os cinco Grandes Lagos xuntos. Desapareceu hai uns 4.000 anos.
O lago Winnipeg é grande, pero tamén é relativamente pouco profundo. É o sexto lago de auga doce máis grande de Canadá e o terceiro máis grande en estar completamente situado dentro de Canadá. É o fogar de moitas illas das cales a maioría permanecen sen desenvolver.