بحيرة وينيبيغ (جنبًا إلى جنب مع بحيرة مانيتوبا) هي بقايا بحيرة أغاسيز التي تعود إلى عصور ما قبل التاريخ من العصر الجليدي الأخير. كانت تلك البحيرة ضخمة لدرجة أنها غيرت مناخ العالم وكانت أكبر من البحيرات الخمس الكبرى مجتمعة. اختفت منذ حوالي 4000 عام.
بحيرة وينيبيغ كبيرة ، لكنها أيضًا ضحلة نسبيًا. إنها سادس أكبر بحيرة للمياه العذبة في كندا وثالث أكبر بحيرة تقع بالكامل داخل كندا. فهي موطن للعديد من الجزر التي لا يزال معظمها غير مطور.