Езерото Уинипег (заедно с езерото Манитоба) са останки от праисторическото езеро Агасис от последната ледникова епоха. Това езеро беше толкова масивно, че промени климата на света и беше по-голямо от петте големи езера взети заедно. Изчезнал е преди около 4000 години.
Езерото Уинипег е голямо, но е и относително плитко. Това е шестото по големина сладководно езеро в Канада и третото по големина, разположено изцяло в Канада. Той е дом на много острови, повечето от които остават неразвити.