โบสถ์นิกายโปรเตสแตนต์แห่ง Saint-Thomas เป็นตัวอย่างที่ยอดเยี่ยมของศิลปะโกธิคแบบอาลเซเชียน ต้นกำเนิดของอาคารโบสถ์ย้อนกลับไปที่อารามเบเนดิกตินตั้งแต่ปี 600 อารามแห่งนี้อุทิศให้กับอัครสาวกโธมัส บิชอป Adalog สั่งให้สร้างโบสถ์และโรงเรียนใหม่ที่นี่ในศตวรรษที่ 9 อย่างไรก็ตาม ในปี ค.ศ. 1007 ฟ้าผ่าลงมาที่ตัวอาคารและไฟได้ทำให้อาคารกลายเป็นเศษหินหรืออิฐ การก่อสร้างจริงของโบสถ์อย่างที่เรารู้ในทุกวันนี้จึงเริ่มขึ้นในศตวรรษที่ 12 ด้วยสิทธิพิเศษ การก่อสร้างด้านหน้าอาคารจึงเริ่มขึ้นได้ในปี 1196 ส่วนที่เก่าแก่ที่สุดของโบสถ์คือโบสถ์ Blasius ทางเหนือของคณะนักร้องประสานเสียง โบสถ์สร้างเสร็จในปลายศตวรรษที่ 13 ในปี ค.ศ. 1330 ได้มีการเพิ่มโบสถ์อีกสองแห่ง เมือง Strasbourg จัดให้มีการก่อสร้างโรงเรียนในปี ค.ศ. 1536โบสถ์เซนต์โทมัสเป็นโบสถ์โถงทางเดินห้าห้อง ความยาวภายใน 65 เมตร ความกว้าง 30 เมตร และความสูงภายใน 22 เมตร ในแง่ของสไตล์ อาคารนี้แสดงถึงส่วนผสมขององค์ประกอบแบบโรมาเนสก์และโกธิค องค์ประกอบของอาคารที่เก่าแก่ที่สุดยังคงเป็นประเพณีของโรมาเนสก์ เช่น หอคอยประตูขนาดใหญ่ ปีกที่มีหอคอยข้ามซึ่งสร้างขึ้นในศตวรรษที่ 13 และคณะนักร้องประสานเสียงมีรูปแบบโกธิค โบสถ์ด้านข้างซึ่งไม่ได้สร้างขึ้นจนกระทั่งศตวรรษที่ 16 เป็นแบบโกธิคตอนปลาย จากหน้าต่างกระจกตะกั่วยุคกลางดั้งเดิม มีเพียงหน้าต่างกุหลาบเท่านั้นที่ยังคงอยู่ในด้านหน้าอาคาร หน้าต่างที่เหลือส่วนใหญ่ตกแต่งด้วยลวดลายต้นไม้ หลังจากที่ภาพนักบุญจำนวนมากตกเป็นเหยื่อของพวกลัทธินิกายลูเทอแรนโบสถ์เซนต์โทมัสเปลี่ยนมานับถือนิกายลูเธอรันในปี ค.ศ. 1524 โบสถ์เซนต์โทมัสหันไปนับถือนิกายลูเธอรัน แม้ว่าฝรั่งเศสคาทอลิกจะยึดครองแคว้นอาลซัส แต่คริสตจักรก็ยังคงรักษาความเป็นนิกายลูเทอแรนไว้ได้ เช่นเดียวกับมูลนิธิวิทยาลัยและทรัพย์สิน ต่อมา โบสถ์โธมัสเคียร์ชเป็นสถานที่ที่ฟรีดริช สปิตตาซ้อมการนมัสการรูปแบบใหม่ในแนวทางของ "ขบวนการพิธีกรรมแบบเก่า"Andreas Silbermann ประสบความสำเร็จในการสร้างออร์แกนอันสง่างามใน Thomaskirche ในศตวรรษที่ 17 Wolfgang Amadeus Mozart เล่นในปี 1778 และต่อมา Albert Schweitzer เพื่อรำลึกถึง Johann Sebastian Bach ในปี 1979 ออร์แกน Silbermann ได้รับการบูรณะโดย Alfred Kern นอกจากออร์แกน Silbermann แล้ว Thomaskirche ยังมีออร์แกนชิ้นที่สองซึ่งมีขนาดเล็กกว่าอีกด้วย ในปี 1905 Fritz Haerpfer ได้สร้างออร์แกนประสานเสียงขนาดเล็กขึ้นตามแผนของ Albert Schweitzerโบสถ์เซนต์โทมัสมีชื่อเสียงในด้านอนุสรณ์สถานที่ฝังศพ อนุสาวรีย์มีอายุระหว่างปี ค.ศ. 1130 ถึง 1850 รวมถึงหลุมฝังศพแบบโรมาเนสก์ของ Bishop Adelog จากศตวรรษที่ 12 สิ่งที่ควรค่าแก่การชมคือหลุมฝังศพของผู้บัญชาการทหารฝรั่งเศส มอริตซ์แห่งแซกโซนี ซึ่งเสียชีวิตในปี พ.ศ. 2393 อนุสาวรีย์นี้สร้างเสร็จในปี พ.ศ. 2319 โดยฌอง-แบปติสต์ ปิกัลล์ หลุมฝังศพที่โอ่อ่าตั้งอยู่ในช่องแหกคอกและแสดงให้เห็นจอมพลกำลังเดินลงบันไดเข้าไปในโลงศพ ในขณะที่ชาวฝรั่งเศสที่วาดเป็นรูปเป็นร่างพยายามรั้งเขาไว้
