Церква Святого Фоми найбільш відома як місце, де Йоганн Себастьян Бах працював капельмейстером (музичним керівником) з 1723 року до своєї смерті в 1750 році, а також як місце знаходження його останків.З 1950 року кістки Йоганна Себастьяна Баха поховані в Томаскірхе. Ще одна примітна особливість Thomaskirche полягає в тому, що вона містить два органи. Більш старий-романтичний орган Вільгельма Зауера, побудований в 1885-89 роках. Оскільки цей орган вважається "непридатним" для музики Баха, другий орган був побудований компанією з виробництва органів Джеральда Уела в 1999-2000 роках. Цей "орган Баха" був сконструйований так, щоб бути схожим на старий орган, на якому Бах грав у Paulinerkirche.На дзвіниці Святого Фоми чотири дзвони. Найбільша з них - "Глоріоза", відлита Теодеріхом Рейнхардом в 1477 році.
